Parserizzare un file FASTQ, SAM o multifasta (scegliere un formato, il multifasta e’ il piu’ difficile), fornito dall’utente, stampando alla fine:
La lunghezza k dei k-mer deve anch’essa essere passata dall’utente.
Questo e’ il progetto piu’ impegnativo, quindi sceglietelo solo se vi sentite dei bravi perlini/e.
Parserizzare un file VCF, fornito dall’utente, e stampare solo le righe del file che soddisfino questi criteri:
This post contains the instructions for the Perl project. This page will be updated when needed.
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Today we split the tasks into two categories:
Questo tutorial permette di ripassare passo passo i fondamenti di Perl. Suggeriamo a chi si sente meno sicuro di fare questo tutorial in classe, mentre per gli altri può essere utile farlo a casa come ripassino.
This short tutorial is to remember how to read a file from Perl. You should remember that it’s a two steps strategy: