Carissimi, vi comunichiamo la data di consegna dei vostri progetti: il 20 maggio alle 23.00. Cogliamo l’occasione per anticiparvi i criteri di valutazione.
Ricordatevi di iscrivere il vostro gruppo come spiegato in questa pagina.
Carissimi, vi comunichiamo la data di consegna dei vostri progetti: il 20 maggio alle 23.00. Cogliamo l’occasione per anticiparvi i criteri di valutazione.
Ricordatevi di iscrivere il vostro gruppo come spiegato in questa pagina.
Lo scopo di questo progetto e’ creare uno script perl che parserizzi (legga e decodifichi) un file in formato FASTQ e che stampi delle semplici statistiche sulle sequenze contenute.
Lo scopo di questo progetto e’ creare uno script perl che parserizzi (legga e decodifichi) un file in formato SAM e che stampi delle semplici statistiche sugli allineamenti contenuti.
Lo scopo di questo progetto e’ creare uno script perl che parserizzi (legga e decodifichi) un file in formato FASTA e che stampi delle semplici statistiche sulle sequenze contenute.
Lo scopo di questo progetto e’ creare uno script perl che parserizzi (legga e decodifichi) un file in formato SAM e che stampi delle semplici statistiche sugli allineamenti contenuti.
Parserizzare un file FASTQ, SAM o multifasta (scegliere un formato, il multifasta e’ il piu’ difficile), fornito dall’utente, stampando alla fine:
La lunghezza k dei k-mer deve anch’essa essere passata dall’utente.
Questo e’ il progetto piu’ impegnativo, quindi sceglietelo solo se vi sentite dei bravi perlini/e.
Parserizzare un file VCF, fornito dall’utente, e stampare solo le righe del file che soddisfino questi criteri:
This post contains the instructions for the Perl project. This page will be updated when needed.
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