Carissimi, vi comunichiamo la data di consegna dei vostri progetti: il 20 maggio alle 23.00. Cogliamo l’occasione per anticiparvi i criteri di valutazione.
Ricordatevi di iscrivere il vostro gruppo come spiegato in questa pagina.
Carissimi, vi comunichiamo la data di consegna dei vostri progetti: il 20 maggio alle 23.00. Cogliamo l’occasione per anticiparvi i criteri di valutazione.
Ricordatevi di iscrivere il vostro gruppo come spiegato in questa pagina.
Lo scopo di questo progetto e’ creare uno script perl che parserizzi (legga e decodifichi) un file in formato FASTQ e che stampi delle semplici statistiche sulle sequenze contenute.
Lo scopo di questo progetto e’ creare uno script perl che parserizzi (legga e decodifichi) un file in formato SAM e che stampi delle semplici statistiche sugli allineamenti contenuti.
Lo scopo di questo progetto e’ creare uno script perl che parserizzi (legga e decodifichi) un file in formato FASTA e che stampi delle semplici statistiche sulle sequenze contenute.
Lo scopo di questo progetto e’ creare uno script perl che parserizzi (legga e decodifichi) un file in formato SAM e che stampi delle semplici statistiche sugli allineamenti contenuti.
Nello scorso laboratorio abbiamo visto due cose molto importanti: come ricevere parametri dalla shell e come leggere file. Nonostante la spiegazione anti-caos preventiva, sembra che molti di voi le trovino problematiche e quindi oggi cercheremo di fare degli esercizi mirati su questi argomenti nuovi, che sono fondamentali per raggiungere gli scopi del corso (fare un programma perl che c’entri qualcosa con la genomica).
In the exercises until now we worked with input values that were written in the beginning of the programs. This is not how real programs work. Since we now know how to read files and pass parameters, we can start writing useful programs, that work in the same way as the shell commands we saw: taking their input from files.
Here is the solution to the fourth homework, hw4. Continue reading
Today we are going to learn about a new function with the friendly name of “substr”! Its purpose is to extract a piece of a string, also known as substring. This is homework hw6.